TAP CCAAT_HAP5 (NF-YC) in Panicum virgatum

Full lineage¹: cellular organisms; Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Streptophytina; Embryophyta; Tracheophyta; Euphyllophyta; Spermatophyta; Magnoliopsida; Mesangiospermae; Liliopsida; Petrosaviidae; commelinids; Poales; Poaceae; PACMAD clade; Panicoideae; Panicodae; Paniceae; Panicinae; Panicum; Panicum sect. Hiantes

Protein source: Phytozome (proteins from primary transcripts)


The colour code corresponds to the rules for the domains:

should be contained
should not be contained

Domain rules

NF-YC
CCAAT-Dr1_Domain
NF-YB
HMG_box

(Domain names are clickable)



List of proteins (28)

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Pavir.Ga00522.1.ppacid=30304760 transcript=Pavir.Ga00522.1 locus=Pavir.Ga00522 ID=Pavir.Ga00522.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Gb00223.1.ppacid=30224573 transcript=Pavir.Gb00223.1 locus=Pavir.Gb00223 ID=Pavir.Gb00223.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Hb01149.1.ppacid=30266190 transcript=Pavir.Hb01149.1 locus=Pavir.Hb01149 ID=Pavir.Hb01149.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ia00103.1.ppacid=30209419 transcript=Pavir.Ia00103.1 locus=Pavir.Ia00103 ID=Pavir.Ia00103.1.v1.1 annot-version=v1.1
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Pavir.Ib01047.1.ppacid=30240353 transcript=Pavir.Ib01047.1 locus=Pavir.Ib01047 ID=Pavir.Ib01047.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.Ib04487.1.ppacid=30238677 transcript=Pavir.Ib04487.1 locus=Pavir.Ib04487 ID=Pavir.Ib04487.1.v1.1 annot-version=v1.1
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Pavir.J21505.1.ppacid=30199325 transcript=Pavir.J21505.1 locus=Pavir.J21505 ID=Pavir.J21505.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J25453.1.ppacid=30219489 transcript=Pavir.J25453.1 locus=Pavir.J25453 ID=Pavir.J25453.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J29091.1.ppacid=30273842 transcript=Pavir.J29091.1 locus=Pavir.J29091 ID=Pavir.J29091.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J34239.1.ppacid=30277948 transcript=Pavir.J34239.1 locus=Pavir.J34239 ID=Pavir.J34239.1.v1.1 annot-version=v1.1
Pavir.J40808.1.ppacid=30257245 transcript=Pavir.J40808.1 locus=Pavir.J40808 ID=Pavir.J40808.1.v1.1 annot-version=v1.1
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A list of species letter codes included in the protein names can be found here (opens in new tab).

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¹ Information recieved using NCBI E-utilities and NCBI taxonomy database.
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